Dokumentation · Dateien

Manifestformat & Beispieldateien.

Der zweite Schritt des Auftragsassistenten sagt im Produkt: „Laden Sie das aus Ihrem LIS exportierte Auftragsmanifest hoch und prüfen Sie anschließend die eingelesenen Accessions.“ Hier sehen Sie den Aufbau dieser Datei – vierzehn Spalten, eine Zeile pro Probe – sowie zwei fiktive Dateien, mit denen Sie den gesamten Ablauf vor Ihren ersten echten Proben durchspielen können.

Vierzehn Spalten, eine Zeile pro Probe

Das Manifest ist die CSV-Datei, die Ihr LIS bereits exportiert. Dies sind die vierzehn Spalten, die der Parser einliest, mit der eigenen Seed-Zeile des Demo-Labors als Beispiel.

#SpalteInhaltBeispiel
1KundeDer auftraggebende Kunde, an den der Bericht der Accession zurückgehtElite Lab
2AccessionIhre Accession-⁠ID für die ProbeE2305080189
3Referenz-AccessionDie eigene Referenz des Auftraggebers für dieselbe ProbeIP234234
4Vorname des PatientenDer Vorname des PatientenMichael
5Zweiter Vorname des PatientenLeer, wenn keiner vorhanden istR
6Nachname des PatientenDer Familienname des PatientenAnderson
7GeburtsdatumGeburtsdatum2000-08-20
8GeschlechtWie im Auftrag erfasstMale
9TestDas auszuführende Panel anhand seines KurznamensUTI
10ProbentypWas entnommen wurdeUrine
11EntnahmedatumWann die Probe entnommen wurde2023-05-08
12EingangsdatumWann sie in Ihrem Labor eingegangen ist2023-05-09
13ArztDer auftraggebende ArztDr. Rao
14EinrichtungDie auftraggebende EinrichtungElite Lab

Nach dem Parsen prüfen Sie die Accessions, bevor etwas erstellt wird – und ein falsch eingelesenes Feld muss nicht neu eingegeben werden: Wählen Sie die Zeilen aus und ändern Sie Kunde, Entnahmedatum, Eingangsdatum, Test oder Probentyp in einem Schritt.

Kopfzeilen und Dateien, die in Fünfergruppen eintreffen

Skip rows legt fest, wie viele Zeilen der Parser vor Beginn der Daten überspringt – standardmäßig 1, die Kopfzeile, und jede Ergebnisdatei hat ihre eigene Einstellung. Legen Sie mehrere Manifestdateien zu einem Auftrag ab, werden sie zusammengeführt statt miteinander zu kollidieren. Die Software passt sich der Datei an, nicht umgekehrt.

Zwei Beispieldateien, durchgehend fiktiv

Keiner der Patienten in den beiden Dateien existiert, sodass Sie einen Auftrag vom Upload bis zum freigegebenen Bericht ohne eine einzige echte Probe auf unserer Seite durchspielen können – und ohne PHI. Das Manifest entspricht den vierzehn Spalten oben; die Ergebnisdatei stimmt Accession für Accession damit überein.

sample-manifest.csv

Ein Auftragsmanifest im Format mit vierzehn Spalten – mit einigen fiktiven Accessions.

sample-results.csv

Die passende Instrumentenergebnisdatei, bereit zum Anhängen im Schritt Ergebnis hochladen.

Häufig gefragt, hier beantwortet

Kann ich mehr als ein Manifest zu einem Auftrag hochladen?
Ja. Der Multi-Datei-Import analysiert jede Datei und führt die Accessions in demselben Auftrag zusammen. Die Prüftabelle zeigt die kombinierte Liste, bevor etwas erstellt wird.
Mein Export enthält vor der Kopfzeile einen Vorspann.
Erhöhen Sie Skip rows, bis die erste Datenzeile die erste eingelesene Zeile ist. Ergebnisdateien haben dieselbe Einstellung pro Datei.
Welche Ergebnisdateien kann ich anhängen?
Der Ergebnisdateityp wird pro Datei ausgewählt – darunter BioRad-Cfx-Exporte – und die Instrumentenliste umfasst die QuantStudio- und CFX-Produktlinien. Jedes Target wird anhand des Namens in der Ergebnisdatei Zeichen für Zeichen exakt mit dem abgeglichen, was das Instrument geschrieben hat.

Auftrag erstellen.

Das Versprechen des Assistenten gilt über den gesamten Ablauf: „Sie können in jedem Schritt als Entwurf speichern und später weitermachen.“ Beginnen Sie mit den Beispieldateien, dann wird das erste echte Manifest keine Überraschungen bereithalten.

Eine Datei lässt sich nicht analysieren? support@pcrlabpro.com.