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Format du manifeste et fichiers d’exemple.

La deuxième étape de l’assistant de commande indique dans le produit : « Importez le manifeste de commande exporté depuis votre LIS, puis vérifiez les accessions analysées. » Voici la structure de ce fichier — quatorze colonnes, une ligne par échantillon — ainsi que deux fichiers fictifs pour parcourir tout le processus avant vos premiers vrais échantillons.

Quatorze colonnes, une ligne par échantillon

Le manifeste est le fichier CSV que votre LIS exporte déjà. Voici les quatorze colonnes que l’analyseur lit, avec la ligne d’exemple du laboratoire de démonstration.

#ColonneContenuExemple
1clientLe client prescripteur auquel le rapport de l’accession est renvoyéElite Lab
2accessionVotre identifiant d’accession pour l’échantillonE2305080189
3accession de référenceLa propre référence du prescripteur pour le même échantillonIP234234
4prénom du patientLe prénom du patientMichael
5deuxième prénom du patientVide lorsqu’il n’y en a pasR
6nom du patientLe nom de famille du patientAnderson
7date de naissanceDate de naissance2000-08-20
8sexeTel qu’il est enregistré sur la commandeMale
9testLe panel à utiliser, selon son nom courtUTI
10type d’échantillonCe qui a été prélevéUrine
11date de prélèvementDate à laquelle l’échantillon a été prélevé2023-05-08
12date de réceptionDate à laquelle il est arrivé dans votre laboratoire2023-05-09
13médecinLe médecin prescripteurDr. Rao
14établissementL’établissement prescripteurElite Lab

Après l’analyse, vous vérifiez les accessions avant toute création — et si un champ a été mal analysé, vous pouvez le modifier en masse plutôt que de le saisir à nouveau : sélectionnez les lignes et modifiez le client, la date de prélèvement, la date de réception, le test ou le type d’échantillon en une seule opération.

Lignes d’en-tête et fichiers qui arrivent par cinq

Skip rows indique à l’analyseur combien de lignes ignorer avant le début des données — la valeur par défaut est 1, la ligne d’en-tête, et chaque fichier de résultats possède son propre réglage. Déposez plusieurs fichiers de manifeste sur une même commande : ils sont fusionnés au lieu de se contredire. Le logiciel s’adapte au fichier, et non l’inverse.

Deux fichiers d’exemple, fictifs de bout en bout

Aucun patient présent dans ces deux fichiers n’existe, vous pouvez donc parcourir une commande de l’import jusqu’au rapport diffusé sans aucun véritable échantillon de notre côté — et sans PHI. Le manifeste correspond aux quatorze colonnes ci-dessus ; le fichier de résultats correspond accession par accession.

sample-manifest.csv

Un manifeste de commande au format quatorze colonnes — quelques accessions fictives.

sample-results.csv

Le fichier de résultats correspondant de l’instrument, prêt à être joint à l’étape Importer le résultat.

Questions déjà posées, réponses ici

Puis-je importer plusieurs manifestes dans une même commande ?
Oui. L’import multi-fichiers analyse chaque fichier et fusionne les accessions dans la même commande ; le tableau de vérification affiche la liste combinée avant toute création.
Mon export contient un préambule au-dessus de la ligne d’en-tête.
Augmentez Skip rows jusqu’à ce que la première ligne de données soit la première ligne lue. Les fichiers de résultats possèdent le même réglage, fichier par fichier.
Quels fichiers de résultats puis-je joindre ?
Le type de fichier de résultats est choisi pour chaque fichier — notamment les exports BioRad-Cfx — et la liste des instruments couvre les gammes QuantStudio et CFX. Chaque cible est associée à partir du Nom dans le fichier de résultats, caractère par caractère, exactement comme l’instrument l’a écrit.

Passer la commande.

La promesse de l’assistant reste valable jusqu’au bout : « Vous pouvez Enregistrer comme brouillon à chaque étape et terminer plus tard. » Commencez avec les fichiers d’exemple, et votre premier vrai manifeste ne réservera aucune surprise.

Un fichier qui ne peut pas être analysé ? support@pcrlabpro.com.